A licença foi cancelada logo em 19 de Maio, mas só hoje foi anunciada pelos documentos públicos disponíveis no Registo das Sociedades, segundo relato da agência France-Presse.
O autoproclamado pastor tinha exortado os seguidores do seu movimento a jejuar até à morte para "encontrar Jesus", um caso que chocou os quenianos após à descoberta de cadáveres na floresta de Shakahola, perto da cidade costeira de Malindi.
Até à data, foram encontrados 425 corpos na floresta.
Embora a maioria das vítimas tenha morrido de fome, as autópsias revelaram também que algumas, incluindo crianças, foram estranguladas, espancadas ou sufocadas.
As autoridades também proibiram de funcionar quatro outros cultos, incluindo o Centro de Oração e Igreja Nova Vida, dirigido pelo evangelista Ezekiel Odero, que tem ligações a Mackenzie.
Odero, que foi detido em Abril, na sequência da descoberta de restos humanos na floresta de Shakahola, está a ser investigado no âmbito da acusação de homicídio, auxílio ao suicídio, radicalização e branqueamento de capitais.
Os procuradores estabeleceram uma ligação entre os dois evangelistas, mas Odero foi libertado sob fiança em Maio, enquanto na semana passada um tribunal prorrogou a detenção de Mackenzie por 47 dias devido a novas investigações.
Sendo um país predominantemente cristão, o Quénia vê-se confrontado com a proliferação descontrolada de igrejas e seitas, cujos líderes sem escrúpulos se aproximam frequentemente de comportamentos criminosos.
As anteriores tentativas do governo para controlar estes movimentos depararam-se com uma feroz oposição, com os críticos a denunciarem um ataque às garantias constitucionais relativas à separação entre a Igreja e o Estado.
Existem 4.000 cultos registados no Quénia, um país com 53 milhões de habitantes, de acordo com dados do Governo.
Muitas delas, lideradas por pastores carismáticos, pregam o chamado evangelho da prosperidade, apelando aos fiéis para que façam donativos substanciais à sua igreja em troca da promessa de uma melhoria da sua própria situação financeira.